소프트웨어가 정품임을 증명하기 위해서는 원칙적으로 정품 CD와 라이선스(사용허락계약서 또는 사용자증서)를 보유하고 있어야 합니다. 정품 CD를 분실한 경우에는 원칙적으로는 새로 구입해야 합니다. 물론, 저작권사에 따라서는 사용자 등록을 한 경우에 새로운 CD를 저렴하게 구매하거나 무료로 사용할 수 있도록 하고 있으므로 정품 CD를 분실한 경우에는 저작권사로 직접 문의 하도록 해야 합니다.
또한, 정품 CD를 분실한 경우에도 경우에 따라서는 저작권사에서 정품CD 구매 사실을 가지고 정품 사용을 인정해 주는 경우도 있을 수 있으니 이 또한 사용자가 직접 저작권사에 문의 하는 것이 좋습니다. 이 때 입증이 가능한 증서나 서면확인서(이메일 포함)를 받는 것도 하나의 방법입니다.
그런데 말씀하신 소프트웨어 박스의 경우에는 정품 소프트웨어를 사용하는 것을 직접적으로 증명하는 것은 아니기 때문에 반드시 소지하고 있을 필요는 없습니다. 따라서 정품CD와 라이선스 증서 등을 보관해 둔 뒤에 소프트웨어 박스는 폐기하여도 괜찮습니다.